โรงเรียนปากช่องเปิดสอนในระดับระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น จำนวน 13  ห้องเรียน  โดยมีหลักสูตรดังนี้

• หลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน ตามหลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551  (ห้อง 1-11)
• หลักสูตรเน้นวิทย์ – คณิต ตามหลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551  (ห้อง 12)
• หลักสูตรเน้น English Program ตามหลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 13)

• หลักสูตรเน้นวิทย์ – คณิต ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขึ้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 1-6) 
• หลักสูตรความสามารถพิเศษทางวิทย์ – คณิต (Gifted) ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขึ้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 7)
• หลักสูตรเน้นวิทย์ – คณิต (Intensive Program) ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขึ้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 8)
• หลักสูตรเพิ่มเติมคณิต – จีน ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขึ้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 9) 
• หลักสูตรเพิ่มเติมจีน ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขึ้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 10-11) 
• หลักสูตรเพิ่มเติมญี่ปุ่น ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขึ้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 12) 
• หลักสูตรเพิ่มเติมคอมพิวเตอร์ ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขึ้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 13) 
• หลักสูตรพิ่มเติมศิลปะ ตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขึ้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 (ห้อง 14)